โดยทั่วไปแล้ว ผู้ป่วยฝีดาษวานรจะได้รับการรักษาตามความรุนแรงของอาการผูะ้ป่วยและขึ้นอยู่กับดุลยพินิจของแพทย์ผู้ดูแลรักษา โดยมี 2 แนวทาง ดังนี้

1.ผู้ป่วยที่มีอาการเล็กน้อย หรืออาการไม่รุนแรง

ผู้ป่วยได้รับการวินิจฉัยจากแพทย์ว่าไม่มีอาการรุนแรง ไม่มีโอกาสเสี่ยงต่อโรครุนแรง และจะได้รับการรักษาตามอาการ

-ได้รับการรักษาที่โรงพยาบาล : แพทย์วินิจฉัยว่าไม่มีอาการรุนแรง และไม่สามารถแยกกักตัวที่บ้านได้ ก็จะได้รับการรักษาที่โรงพยาบาล

-รักษาโดยแยกกักตัวที่บ้าน : แพทย์วินิจว่าผู้ป่วยสามารถเข้ารับการรักษาโดยแยกกักตัวที่บ้านได้ (Home Isolation)

2. ผู้ป่วยที่มีโอกาสเสี่ยงต่อโรครุนแรง

เป็นผู้ป่วยโรคฝีดาษวานรที่มีอาการรุนแรง หรือมีภาวะแทรกซ้อนจะได้รับการรักษาด้วยยาต้านไวรัส เทคโควิริแมท (Teovirimat) เพื่อลดความเสี่ยง อาการแทรกซ้อน นานประมาณ 21 วันหรือจนกว่า ผื่น ตุ่ม จะตกสะเก็ดและหลุดลอกออกหมด