ภารกิจพื้นฐานของสำนักอนามัยทั้ง 7 ด้าน ได้แก่

1. สร้างเสริมสุขภาพ ป้องกันและควบคุมโรค

2. รักษาพยาบาลปฐมภูมิ ฟื้นฟูสุขภาพ

3. สาธารณสุขมูลฐานและเครือข่ายสุขภาพ

4. ป้องกัน บำบัดรักษา และฟื้นฟูการติดยาเสพติดและสารเสพติด

5. สนับสนุนระบบบริการสุขภาพ

6. สุขาภิบาลอาหารและอนามัยสิ่งแวดล้อม

7. นโยบายและบริหารจัดการ